A Far Cry 3-ban Jason Brody cipőjébe bújsz, aki a világ végén, egy elhagyatott trópusi szigeten ragad. Ebben a világban, ahol a törvénytelenség, az erőszak és a vadállati ösztönök az egyetlen biztos dolog, Brody egyedül vívja meg harcát azzal a világgal, mely régen elveszítette a jó és a rossz helyes értelmezésének képességét.